目的:分析假交替單胞菌(Pseudoalteromonas tetraodonis)來源κ-卡拉膠酶的結構域,構建結構域截短突變體,探究非催化結構域對假交替單胞菌κ-卡拉膠酶的酶學性質與結構的影響。方法:利用大腸桿菌異源表達假交替單胞菌κ-卡拉膠酶WT和僅包含糖苷水解酶催化結構域的κ-卡拉膠酶截短體GH(缺失免疫球蛋白(immunoglobulin,Ig)樣結構域),利用3,5-二硝基水楊酸法研究κ-卡拉膠酶WT和GH的酶學性質,利用分子對接和分子動力學模擬研究酶微觀結構的變化。結果:成功對假交替單胞菌κ-卡拉膠酶WT及其截短體GH進行體外表達,WT和GH的分子質量分別為44.0 kDa和35.0 kDa,均能專一性地酶解κ-卡拉膠底物。酶學性質研究發(fā)現,假交替單胞菌κ-卡拉膠酶的Ig樣結構域不影響酶的底物特異性、最適反應溫度、最適反應pH值和κ-卡拉膠酶解產物的組成,但降低了酶的熱穩(wěn)定性、強酸(pH 4.0)和強堿(pH 11.0)穩(wěn)定性、酶對底物的親和力。酶的分子對接及分子動力學模擬分析結果表明,Ig樣結構域截短后,κ-卡拉膠酶與κ-卡拉膠四糖底物的相互作用增強,酶結構的剛性增強,κ-卡拉膠酶F1、F3和F5指狀區(qū)環(huán)狀結構柔性降低,F2和F6指狀區(qū)β片層結構柔性升高,這些結構的改變可能是截短體GH催化活性和熱穩(wěn)定性提高的原因。結論:本研究解析了假交替單胞菌κ-卡拉膠酶的非催化Ig樣結構域與酶性質的構效關系,可為該酶結構與功能研究及酶的應用提供理論基礎。
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