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應(yīng)用16S rDNA分析撒壩火腿表面和內(nèi)部微生物多樣性
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 195 發(fā)表時(shí)間: 2021-01-08
作者: 張雅靖,舒相華,黃 鑫,呂 濤,王余磊,張雅倫,張智慧,羅 高,李鑫漢,李向楠,宋春蓮
關(guān)鍵詞: 撒壩火腿;微生物多樣性;高通量測(cè)序;16S rDNA
摘要:

為分析云南撒壩火腿中微生物的菌群構(gòu)成、物種豐富度和多樣性差異,以1 年以上的撒壩火腿為研究對(duì)象,通過提取DNA,采用Illumina高通量測(cè)序方法對(duì)火腿表面和內(nèi)部細(xì)菌的16S rDNA V3~V4區(qū)和真菌ITS2區(qū)進(jìn)行擴(kuò)增和測(cè)序,并對(duì)其菌落構(gòu)成和多樣性進(jìn)行分析。結(jié)果表明:撒壩火腿中微生物菌群存在差異,細(xì)菌豐富度極顯著高于真菌(P<0.01),多樣性高于真菌,且內(nèi)部真菌和細(xì)菌微生物多樣性和豐富度均高于表面;子囊菌門下曲霉菌屬是表面和內(nèi)部真菌中的優(yōu)勢(shì)菌群,其次Yamadazyma和青霉菌屬也是主要菌群,這些菌屬在火腿表面的分布多于內(nèi)部;厚壁菌門下葡萄球菌屬是火腿表面和內(nèi)部細(xì)菌中的優(yōu)勢(shì)菌群,色鹽桿菌、酸桿菌和鏈球菌也是表面的主要菌群;放線菌、桿菌屬、酸微菌綱及球菌屬則是火腿內(nèi)部的主要菌群,此外火腿內(nèi)部還存在大量未知微生物。綜上所述,曲霉菌和葡萄球菌是撒壩火腿表面和內(nèi)部的優(yōu)勢(shì)菌群。

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