本研究通過培養(yǎng)法結(jié)合聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)基因檢測,從西北地區(qū)150 份嬰兒糞便樣品中分離并鑒定出23 株長雙歧桿菌嬰兒亞種(Bifidobacterium longum subsp. infantis,B. infantis),分離率僅為10.67%,并對其基因組、益生特性進(jìn)行了比較分析。基因組分析表明,B. infantis的平均GC含量、基因組長度、編碼序列數(shù)量分別為59.81%、2.61 Mb、2 273;基于核心基因的系統(tǒng)發(fā)育分析及平均核苷酸一致性分析表明,相同地理宿主來源的菌株具有較高遺傳相似性,其菌株系統(tǒng)發(fā)育更相近。不同菌株基因組中與植物源碳水化合物代謝相關(guān)的基因存在差異。碳水化合物代謝實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,絕大部分B. infantis菌株能夠代謝低聚半乳糖、低聚果糖、菊糖等益生元,與糖苷水解酶(glycoside hydrolase,GH)32、GH43在其基因組中的存在相印證,4 株菌(A47X1、A79X4、A79X3、S19X4)能夠利用木糖。菌株B. infantis S8X8、S5X8_2能最有效地抑制致瀉大腸埃希氏菌、產(chǎn)腸毒素大腸埃希氏菌、鼠傷寒血清型腸沙門氏菌腸亞種、出血性大腸埃希氏菌、血清型腸炎沙門氏菌,但不能抑制單核細(xì)胞增生李斯特菌。B. infantis的基因組中檢測到利福平抗性基因、莫匹羅星抗性基因、氨基糖苷類抗性基因等內(nèi)源性抗性基因,未檢測到致病性毒力因子。所有B. infantis分離株對萬古霉素、慶大霉素和鏈霉素敏感。本研究對中國不同地域人群B. infantis菌株進(jìn)行了有效分離,通過基因型及表型特征分析揭示了菌株的安全性及功能特性,可為針對不同地域嬰幼兒開發(fā)個(gè)性化益生菌制劑提供參考依據(jù)。
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