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C端替換提高酚酸脫羧酶BJ6PAD的底物催化活性及其分子動力學模擬
來源:導入 閱讀量: 149 發(fā)表時間: 2025-05-07
作者: 陳陰竹,李琴,胡凱弟,李建龍,趙寧,茍良遜,劉書亮
關(guān)鍵詞: 酚酸脫羧酶;C端替換;酶學性質(zhì);分子對接;分子動力學模擬
摘要:

酚酸脫羧酶是一種生物催化劑,利用該酶的脫羧反應制備4-乙烯基衍生物具有諸多優(yōu)勢和良好的發(fā)展前景。采用酶蛋白序列C端替換方式改造枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)J6酚酸脫羧酶,以期獲得催化能力更強的突變體,并利用同源建模、分子對接和分子動力學模擬分析酶與底物間的相互作用。結(jié)果表明,C端替換會影響酶的底物親和力和催化效率,所構(gòu)建的突變體BJ6PAD-C1和BJ6PAD-C2對大部分底物酚酸的催化活性有明顯提高,尤其是咖啡酸,較原酶分別提高20.34%和29.97%;且2 個突變酶對阿魏酸、咖啡酸和芥子酸的親和力增強,其中,BJ6PAD-C1對這3 種酚酸的催化效率分別增加4%、24%、145%,BJ6PAD-C2的催化效率分別增加7%、37%、114%。最后通過分子對接對底物結(jié)合關(guān)鍵位點進行預測,發(fā)現(xiàn)C端替換會影響底物結(jié)合腔中關(guān)鍵氨基酸殘基間的相互作用,并利用分子動力學模擬計算,從蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)和能量差異方面確定了影響酶催化性能的原因,即突變可能會擴寬蛋白質(zhì)的入口通道,使配體能夠更易進入底物結(jié)合口袋并發(fā)生反應;同時,酶結(jié)構(gòu)的改變可能會造成底物“脫靶”,從而降低其催化活性。本研究不僅在一定程度上豐富了酚酸脫羧酶資源,也為酚酸脫羧酶結(jié)構(gòu)與功能的研究提供了新思路。

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