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藤椒精油抗芽孢桿菌生物被膜關(guān)鍵組分的分子對(duì)接虛擬篩選與活性評(píng)價(jià)
來源:導(dǎo)入 閱讀量: 141 發(fā)表時(shí)間: 2024-08-04
作者: 肖瑀晗,呂昕昱,張瑩凡,原鵬飛,周曼,侯曉艷,陳安均,張志清,申光輝
關(guān)鍵詞: 分子對(duì)接;生物被膜;藤椒精油;芽孢桿菌;氧化石竹烯;β-石竹烯
摘要:

為探討藤椒精油抗腐敗解淀粉芽孢桿菌生物被膜的關(guān)鍵活性組分及其胞內(nèi)作用靶點(diǎn),根據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道構(gòu)建藤椒精油組分?jǐn)?shù)據(jù)庫(kù)和芽孢桿菌生物被膜形成相關(guān)靶蛋白分子結(jié)構(gòu)集,采用CB-DOCK2進(jìn)行藤椒精油組分與生物被膜形成相關(guān)靶蛋白的分子對(duì)接,根據(jù)分子親和能力篩選精油抗細(xì)菌生物被膜的關(guān)鍵組分及潛在作用靶點(diǎn)。最后通過離體培養(yǎng)結(jié)合結(jié)晶紫染色法進(jìn)行藤椒精油關(guān)鍵活性組分石竹烯和氧化石竹烯的抗生物被膜實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。分子對(duì)接結(jié)果表明,藤椒精油的24 種揮發(fā)性成分與58 個(gè)解淀粉芽孢桿菌生物被膜形成相關(guān)的靶點(diǎn)具有不同的親和能力,其中氧化石竹烯和β-石竹烯可通過超共軛效應(yīng)和疏水相互作用、范德華力等分子間作用力與ComP、RapC緊密結(jié)合并形成穩(wěn)定構(gòu)象。離體生物被膜培養(yǎng)驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)表明,氧化石竹烯和β-石竹烯對(duì)解淀粉芽孢桿菌的最小生物被膜抑制質(zhì)量濃度分別為6.0 mg/mL和2.0 mg/mL。此外,氧化石竹烯和β-石竹烯還能干擾菌體泳動(dòng)能力,降低細(xì)胞初始黏附和自聚集能力,改變細(xì)胞表面疏水性。研究結(jié)果揭示了藤椒精油抗細(xì)菌生物被膜的關(guān)鍵活性組分及其潛在作用靶點(diǎn),并為解析植物精油生物活性相關(guān)胞內(nèi)分子機(jī)理提供了可行的輔助策略。

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