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綠豆7S球蛋白基因鑒定及在籽粒發(fā)育中的表達分析
來源:導入 閱讀量: 152 發(fā)表時間: 2024-08-04
作者: 丁冬會,張雨朋,周人玲,席武洋,耿旎周,常瑋,趙青平,劉嘉斐,楊樹瓊
關鍵詞: 綠豆;7S球蛋白;籽粒發(fā)育;基因鑒定;表達譜分析
摘要:

為闡明綠豆7S(Vigna radiata 7S,Vr7S)球蛋白基因的基本性質及其在籽粒生長發(fā)育過程中的表達模式,本研究運用生物信息學、反轉錄聚合酶鏈式反應(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)對10 個Vr7S球蛋白基因的理化性質、基因結構特征、蛋白三級結構、系統(tǒng)發(fā)育關系及基因表達譜等進行研究。結果表明,Vr7S球蛋白基因編碼的蛋白長度為246~594 個氨基酸,等電點位于5.02~6.40之間,分子質量為27.82~70.02 kDa;所有Vr7S球蛋白基因包含3~7 個外顯子、2~6 個內含子、5~8 個保守基序;除Vr7S B1具有1 個cupin保守結構域外,其余9 個基因均含有2 個cupin結構域;Vr7S球蛋白三級結構有4 種類型,主要包含α-螺旋、β-鏈等結構;在cupin保守結構域中,綠豆和其他物種共有67 個保守氨基酸殘基,綠豆與赤豆7S球蛋白基因間的同源關系最近,其次是菜豆、木豆及大豆等。基于不同綠豆品種、不同發(fā)育時期籽粒的轉錄組測序和RT-PCR表達譜分析顯示,Vr7S球蛋白基因伴隨著綠豆籽粒的發(fā)育成熟呈現表達量升高的趨勢,這與其他豆科物種7S球蛋白基因的表達模式一致,表明其在綠豆籽粒貯藏蛋白的生成調控過程中具有積極作用。本研究為進一步解析Vr7S球蛋白基因在綠豆籽粒發(fā)育中的生物學功能奠定了基礎。

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