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基于非標記蛋白質(zhì)組學技術(shù)篩選影響察哈爾羊肌肉品質(zhì)的重要分子標記
來源:食品科學網(wǎng) 閱讀量: 224 發(fā)表時間: 2019-12-30
作者: 謝遇春,奈日樂,楊 峰,馬麗娜,米 璐,車天宇,郭俊濤,蘇 馨,趙 存,王志新,李金泉,劉志紅
關(guān)鍵詞: 背最長肌;臀肌;差異蛋白;高效液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用法;GO富集分析
摘要:

為研究察哈爾羊不同部位肌肉蛋白質(zhì)組成差異及差異蛋白功能,通過數(shù)據(jù)信息依賴性獲取與SWATH非標記蛋白組學定量技術(shù),對察哈爾羊背最長肌和臀肌進行蛋白質(zhì)鑒定和定量分析,并對其進行生物信息學分析。結(jié)果表明:察哈爾羊背最長肌和臀肌肌肉中共檢測到蛋白質(zhì)1 073 個,篩選出差異蛋白140 個,其中背最長肌中高表達差異蛋白116 個,低表達差異蛋白24 個;背最長肌中高表達差異蛋白GO(gene ontology)功能富集分析結(jié)果表明,在細胞組分中,富集于細胞外外泌體中的蛋白質(zhì)最多,其次富集于細胞膜內(nèi),在分子功能中,蛋白質(zhì)主要參與分子內(nèi)轉(zhuǎn)移酶活性、聚RNA結(jié)合和L-乳酸脫氫酶活性過程,在生物學進程中,蛋白質(zhì)主要參與碳水化合物代謝過程、肌節(jié)組織和肌肉收縮過程;通過差異蛋白的網(wǎng)絡(luò)互作分析發(fā)現(xiàn),肌纖維組成模塊包括肌球蛋白-11、肌球蛋白-1(myosin-1,MYH1)、肌間蛋白-1、肌球蛋白-2(myosin-2,MYH2)、肌球蛋白-8(myosin-8,MYH8)、肌球蛋白輕鏈激酶-2、肌球蛋白輕鏈-2、肌鈣蛋白T-3、視松蛋白和肌球蛋白結(jié)合蛋白C等蛋白質(zhì),肌球蛋白MYH1、MYH2、MYH8有望成為影響肉品質(zhì)的重要分子標記。

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