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葡萄UDP-糖基轉(zhuǎn)移酶家族的全基因組表征、進化和表達分析
來源:導(dǎo)入 閱讀量: 115 發(fā)表時間: 2025-06-23
作者: 王媛媛,劉云清,徐晶宇,劉云婷,胡禧熙,張超,姜澤宇,朱磊
關(guān)鍵詞: 葡萄;尿苷二磷酸糖基轉(zhuǎn)移酶;基因家族;生物信息學(xué)分析;表達分析
摘要:

為了全面掌握葡萄糖基轉(zhuǎn)移酶(VvUGT)家族基因的基本信息,篩選調(diào)控山葡萄花色苷生物合成的候選UGT基因,本研究通過VvUGT的全基因組鑒定、理化性質(zhì)測定、系統(tǒng)進化、染色體定位、基因結(jié)構(gòu)與基序表征對VvUGT家族進行生物信息學(xué)分析,基于GEO數(shù)據(jù)庫芯片平臺(GSE36128)進行VvUGT的表達分析,選擇不同遺傳背景的3 個葡萄品種(‘左山一’‘左紅一’和‘赤霞珠’)果皮作為實驗材料,通過對果實轉(zhuǎn)色過程中花色苷和VvUGT表達的分析,初步篩選參與山葡萄花色苷積累的VvUGT。結(jié)果表明,葡萄UGT家族有230 個成員,分為16 個組(A~P組),蛋白成員主要分布在葉綠體、細胞核和細胞質(zhì)中,其基因分布在除chr10外的18 條染色體上,該家族基因的內(nèi)含子個數(shù)在1~6之間,所有基因均含有PSPG結(jié)構(gòu);組織表達分析表明VvUGT在歐亞種葡萄‘Corvina’中的表達具有組織特異性和時空特異性;花色苷分析結(jié)果表明3 個品種葡萄果皮花色苷的含量和糖基化成分組成差異明顯,轉(zhuǎn)錄組分析表明在果皮轉(zhuǎn)色過程中呈現(xiàn)高表達水平的85 個VvUGT基因表達模式在葡萄品種和生長時期上均表現(xiàn)出顯著差異,通過相關(guān)性分析篩選出Vitvi15g01073.t01、Vitvi15g01643.t01和Vitvi17g00753.t01(5GT)可能在山葡萄花色苷生物合成中發(fā)揮作用。本研究提供了VvUGT基因家族的完整信息,篩選出可能參與山葡萄花色苷生物合成的UGT基因,揭示了其在葡萄皮糖基化中的潛在作用,可為進一步研究候選基因在山葡萄花色苷合成中的功能提供理論依據(jù),為山葡萄品種改良及提升山葡萄酒色澤穩(wěn)定性奠定基礎(chǔ)。

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