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基于熒光光譜法分子動(dòng)力學(xué)模擬探究葛根素與β-乳球蛋白的結(jié)合機(jī)制
來(lái)源:導(dǎo)入 閱讀量: 172 發(fā)表時(shí)間: 2025-03-19
作者: 馬波,李蓉,徐傲,段文杰,黃業(yè)傳
關(guān)鍵詞: 葛根素;β-乳球蛋白;熒光光譜;分子動(dòng)力學(xué)模擬;非共價(jià)相互作用
摘要:

本實(shí)驗(yàn)通過(guò)熒光光譜法、分子對(duì)接技術(shù)、分子動(dòng)力學(xué)模擬對(duì)葛根素(puerarin,PUE)與β-乳球蛋白(β-lactoglobulin,β-lg)的結(jié)合機(jī)制進(jìn)行探究。熒光光譜分析結(jié)果表明,PUE通過(guò)靜態(tài)猝滅有效猝滅了β-lg的熒光,在25、35、45 ℃條件下的結(jié)合常數(shù)分別為7.24×104、1.34×105、2.18×105 L/mol,結(jié)合位點(diǎn)數(shù)分別為1.02、1.18、1.15,因此可知只有一個(gè)或一類結(jié)合位點(diǎn)。同步熒光和三維熒光光譜分析結(jié)果表明PUE與β-lg結(jié)合過(guò)程中導(dǎo)致β-lg的微環(huán)境極性增加,疏水作用力減弱。分子對(duì)接結(jié)果顯示PUE結(jié)合在β-lg的疏水腔內(nèi),與β-lg的6 個(gè)氨基酸殘基形成疏水作用力,5 個(gè)氨基酸殘基形成短氫鍵。分子動(dòng)力學(xué)結(jié)果顯示復(fù)合物中β-lg的均方根誤差(root mean square deviation,RMSD)、回旋半徑、溶劑可及表面積分別為(0.17±0.02)nm、(1.47±0.01)nm、(88.94±2.05)nm2,游離的β-lg RMSD、回旋半徑、溶劑可及表面積分別為(0.22±0.03)nm、(1.48±0.01)nm、(90.09±1.73)nm2,此外復(fù)合物中β-lg的均方根波動(dòng)值同樣低于游離的β-lg,表明PUE/β-lg復(fù)合物在分子層面有更好的穩(wěn)定性。本研究初步揭示了PUE和β-lg的結(jié)合機(jī)制,對(duì)于增加PUE的生物利用度有一定的參考意義。

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