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新疆喀什地區(qū)人體腸道共棲菌瘤胃聯(lián)合乳桿菌菌株的遺傳差異及益生特性比較分析
來源:導(dǎo)入 閱讀量: 115 發(fā)表時(shí)間: 2024-12-30
作者: 尹彤,安美玲,梁智璇,盧嚴(yán)磚,孫海龍,倪永清
關(guān)鍵詞: 瘤胃聯(lián)合乳桿菌;比較基因組學(xué);基因型;益生特性
摘要:

本研究以從健康家庭人體糞便樣品中分離出的16 株瘤胃聯(lián)合乳桿菌(Ligilactobacillus ruminis)菌株為研究對(duì)象,在分析其基因組、系統(tǒng)發(fā)育特征的基礎(chǔ)上,對(duì)菌株的體外益生特性進(jìn)行比較分析。基因組分析表明,L. ruminis菌株的平均基因組大小、基因數(shù)量和GC含量分別為1.4 Mb、1 374 個(gè)、43.55%,尤其菌株間特有基因數(shù)量差異顯著,在3~886 個(gè)之間(菌株K646-58L的特有基因數(shù)量明顯高于其他菌株);系統(tǒng)進(jìn)化分析結(jié)果顯示,同一家族個(gè)體來源的菌株在進(jìn)化樹上并沒有形成以家族為更相近的聚類;碳源利用實(shí)驗(yàn)表明L. ruminis菌株能利用大豆低聚糖、棉子糖無水物和麥芽糊精,不能利用山梨醇和木糖醇,碳水化合物活性酶數(shù)據(jù)庫注釋到大量參與聚糖底物代謝的基因,如糖苷水解酶(glycoside hydrolase,GH)1和GH13基因家族;L. ruminis菌株對(duì)氨基糖苷類抗生素耐藥,對(duì)四環(huán)素類抗生素和氯霉素敏感,與抗性基因預(yù)測(cè)存在不匹配的情況;L. ruminis菌株普遍具有高度的自凝聚能力(>50%)和較好的疏水性(>20%)。L. ruminis菌株基因型特征結(jié)合表型特征的研究說明其具有優(yōu)良的益生特性,尤其是菌株K227-6L和K645-5L,本研究結(jié)果可為潛在益生菌菌株的開發(fā)與應(yīng)用奠定理論基礎(chǔ)。

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