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分子動(dòng)力學(xué)模擬分析超高壓對(duì)固液兩態(tài)多酚氧化酶穩(wěn)定性的影響
來(lái)源:導(dǎo)入 閱讀量: 195 發(fā)表時(shí)間: 2024-08-04
作者: 李鏡浩,梁展鴻,肖更生,徐玉娟,余元善,吳繼軍,彭健,李璐,程麗娜
關(guān)鍵詞: 多酚氧化酶;分子動(dòng)力學(xué)模擬;物理狀態(tài);超高壓;穩(wěn)定性
摘要:

以固態(tài)晶體(crystal,C-)、液態(tài)(liquid,L-)多酚氧化酶(polyphenol oxidase,PPO)為對(duì)象,采用分子動(dòng)力學(xué)模擬的方法,分析其在常溫(298.15 K)常壓/高壓(0.1~400.0 MPa)條件下分子構(gòu)象的變化。結(jié)果表明:固液兩態(tài)PPO的空間結(jié)構(gòu)均隨壓力(0.1~400.0 MPa)增大而變的不穩(wěn)定;與L-PPO相比,C-PPO對(duì)壓力更敏感,表現(xiàn)出更高的殘基波動(dòng),溶劑可及表面積和體積減小,蛋白結(jié)構(gòu)更致密;α-螺旋向無(wú)規(guī)卷曲過(guò)渡,導(dǎo)致氫鍵數(shù)量不穩(wěn)定,螺旋彈性也降低,整體構(gòu)象差異明顯;活性位點(diǎn)Cu2+位置疏遠(yuǎn),殘基之間距離發(fā)生改變、運(yùn)動(dòng)出現(xiàn)隨機(jī)化,干擾底物催化結(jié)合。因此,物理狀態(tài)和壓力改變PPO空間結(jié)構(gòu)、殘基運(yùn)動(dòng)模式和底物結(jié)合范圍,影響酶穩(wěn)定性。因此,PPO狀態(tài)和壓力因素對(duì)酶變性程度可排序?yàn)椋汗虘B(tài)>液態(tài),物理狀態(tài)>壓力水平。

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