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抑制劑去除對(duì)冷凍草莓中諾如病毒RT-PCR檢測(cè)的影響
來(lái)源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 198 發(fā)表時(shí)間: 2017-06-07
作者: 徐文斐,房保海,林 超,王宮璞,王 群,鄭小龍,梁成珠,岳志芹
關(guān)鍵詞: 冷凍草莓|諾如病毒|熒光定量RT-PCR|抑制劑
摘要:

目的:設(shè)計(jì)對(duì)比實(shí)驗(yàn),以冷凍草莓為材料,研究樣品中所含抑制劑對(duì)諾如病毒熒光定量逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)檢測(cè)結(jié)果的影響,優(yōu)化提高檢測(cè)靈敏度與準(zhǔn)確率。方法:GⅡ型諾如病毒便懸液的制備與RNA提取,已知陰性冷凍草莓樣品進(jìn)行前處理、病毒富集、病毒RNA提取純化,分組(對(duì)照組、實(shí)驗(yàn)組),抑制劑去除,熒光定量RT-PCR檢測(cè)。結(jié)果:隨著病毒濃度的梯度遞減,抑制劑影響作用呈明顯增強(qiáng)趨勢(shì),導(dǎo)致在高于正常檢測(cè)最低限度兩個(gè)數(shù)量級(jí)的水平,即出現(xiàn)假陰性結(jié)果;抑制劑去除的實(shí)驗(yàn)組檢測(cè)結(jié)果,隨著病毒濃度梯度的遞減明顯優(yōu)于未經(jīng)處理的對(duì)照組;抑制劑去除的實(shí)驗(yàn)組穩(wěn)定檢出限為10-6(Ct值小于40),最低檢出限為10-7(諾如病毒(norovirus,NoV)濃度梯度檢測(cè)最低檢出限為10-5)。結(jié)論:抑制劑去除可明顯優(yōu)化冷凍草莓中NoV熒光定量RT-PCR檢測(cè),提高檢測(cè)方法的靈敏度,且操作簡(jiǎn)便快捷,檢測(cè)成本浮動(dòng)不大,期望應(yīng)用于日常檢測(cè)工作中。

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