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PCR-DGGE分析資中冬尖發(fā)酵過(guò)程中細(xì)菌多樣性
來(lái)源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 111 發(fā)表時(shí)間: 2017-07-24
作者: 汪?淼,李?張,孫?群
關(guān)鍵詞: 冬尖;聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-變性梯度凝膠電泳;細(xì)菌多樣性
摘要:

目的:采用聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)-變性梯度凝膠電泳(polymerase chain reaction-denatured gradient gel electrophoresis,PCR-DGGE)技術(shù)分析資中冬尖發(fā)酵過(guò)程中微生物群落結(jié)構(gòu)及其動(dòng)態(tài)變化。方法:從資中采集4?份不同發(fā)酵年份冬尖樣品,提取樣品總DNA,采用巢式PCR法擴(kuò)增細(xì)菌16S?rDNA?V3區(qū),擴(kuò)增產(chǎn)物采用DGGE分離,對(duì)細(xì)菌主要優(yōu)勢(shì)條帶進(jìn)行克隆、測(cè)序、構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。結(jié)果:冬尖在發(fā)酵過(guò)程中細(xì)菌多樣性較豐富,且群落結(jié)構(gòu)發(fā)生了較大變化。不同發(fā)酵時(shí)間樣品間,細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)相似性為9%~67%,其中第2年與第3年樣品相似性最高,達(dá)67%。資中冬尖發(fā)酵過(guò)程中,所涉及的細(xì)菌主要分為3?類,分別為厚壁菌門(Firmicutes)、變形桿菌門(Proteobacteria)和非培養(yǎng)菌,其中厚壁菌門為優(yōu)勢(shì)菌群,占53%;變形桿菌門占37%;非培養(yǎng)菌僅占10%。結(jié)論:采用PCR-DGGE技術(shù)能更全面、更真實(shí)地反映資中冬尖在發(fā)酵過(guò)程中微生物群落的多樣性及其動(dòng)態(tài)變化,為冬尖的生產(chǎn)工藝和風(fēng)味物質(zhì)的形成提供理論支撐。

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