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基于比較基因組學(xué)對新疆地區(qū)人源嗜黏蛋白阿克曼氏菌遺傳差異及益生特性的比較分析
來源:導(dǎo)入 閱讀量: 26 發(fā)表時間: 2025-09-17
作者: 史文鳳,安美玲,黃麗麗,倪永清
關(guān)鍵詞: 嗜黏蛋白阿克曼氏菌;益生特性;全基因組;安全性;功能基因
摘要:

本研究從新疆不同地域健康人群糞便中分離得到的12 株嗜黏蛋白阿克曼氏菌(Akkermansia muciniphila),基于基因組系統(tǒng)發(fā)育分析對菌株的遺傳差異進行了比較分析。基因組分析顯示,分離菌株基因組長度為2.64~2.98 Mb,GC含量為55.1%~55.7%。依據(jù)平均核苷酸一致性以及核心基因構(gòu)建系統(tǒng)進化樹,將分離菌株劃分為3 個亞群。分離菌株耐受實驗和表面特性測定結(jié)果顯示,subgroup II菌株對酸和膽鹽耐受性最好,subgroup II菌株在48 h時的自聚集率均在60%以上,15 min后其對二甲苯的疏水性高達(32.00±0.02)%。抗氧化能力分析結(jié)果顯示,subgroup II菌株對1,1-二苯基-2-三硝基苯肼自由基和2,2’-聯(lián)氮雙(3-乙基苯并噻唑啉-6-磺酸)陽離子自由基均表現(xiàn)出更佳的清除能力。溶血實驗結(jié)果顯示所有菌株安全無毒。抗生素耐藥性分析結(jié)果顯示,分離菌株對鏈霉素、慶大霉素等氨基糖苷類抗生素存在一定程度耐藥性,對糖肽類抗生素萬古霉素敏感,耐藥表型與基因檢測不嚴格對應(yīng)。基因組測序顯示,菌株擁有碳水化合物水解酶(glycoside hydrolase,GH)家族基因GH2和GH20。碳源利用譜分析顯示低聚半乳糖、大豆低聚糖、木糖醇等對菌株的增殖具有協(xié)同促進作用。總體上,隸屬于subgroup II的菌株具有優(yōu)良的益生特性,后期可作為益生菌重點開發(fā)利用。

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