領(lǐng)學(xué)術(shù)科研之先，創(chuàng)食品科技之新
—— 中國食品雜志社
為了深入挖掘?qū)δ图籽跷髁纸瘘S色葡萄球菌（methicillin-resistant Staphylococcus aureus，MRSA）具有顯著抑制作用的植物乳植桿菌CHEN1細(xì)菌素基因簇，使用PacBio RS和Illumina測序平臺對植物乳植桿菌CHEN1進(jìn)行全基因組測序，通過antiSMASH軟件和BAGEL4數(shù)據(jù)庫預(yù)測細(xì)菌素基因簇并挖掘潛在的作用機(jī)制。全基因組測序結(jié)果表明，植物乳植桿菌CHEN1基因組大小為3 330 435 bp，GC含量為44.34%，包含1 個染色體序列和8 個質(zhì)粒；含有3 196 個蛋白編碼基因，結(jié)合基因本體論、京都基因與基因組百科全書和蛋白相鄰類的聚簇數(shù)據(jù)庫分別注釋到基因704、2 317、2 775 個。基因組測序數(shù)據(jù)提交至NCBI獲得GenBank登陸號為PRJNA1014938。采用antiSMASH軟件和BAGEL4數(shù)據(jù)庫預(yù)測到3 個與細(xì)菌素相關(guān)的基因簇，分別為T3PKS、RiPPs和IIb類細(xì)菌素，滿足細(xì)菌素表達(dá)的先決條件。該研究可為植物乳植桿菌CHEN1及抑制MRSA細(xì)菌素的開發(fā)與應(yīng)用提供生物信息基礎(chǔ)。
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