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應用高通量測序分析常溫貯藏吳山貢鵝的細菌多樣性
來源:食品科學網 閱讀量: 240 發(fā)表時間: 2021-07-13
作者: 朱東喜,鄧潔瑩,王志琦,汪 洋,李沛軍,徐寶才
關鍵詞: 吳山貢鵝;傳統(tǒng)培養(yǎng);高通量測序;微生物分布;優(yōu)勢腐敗微生物
摘要:

運用傳統(tǒng)培養(yǎng)技術結合高通量測序技術對常溫貯藏吳山貢鵝的菌群結構進行分析,研究吳山貢鵝微生物群落的變化以及導致吳山貢鵝腐敗的微生物分布。結果表明:吳山貢鵝貯藏期間pH值呈現先上升后下降的趨勢,菌落總數則呈現上升的趨勢,貯藏末期吳山貢鵝中菌落總數、乳酸菌、大腸桿菌和假單胞菌的數量分別達到5.76、5.21、2.13、2.96 (lg(CFU/g));高通量測序分析表明,在門水平上,貯藏初期和中期,吳山貢鵝中的優(yōu)勢菌門均為變形菌門,其相對豐度分別達到88%(初期)和87%(中期),貯藏末期的優(yōu)勢菌門為厚壁菌門,相對豐度84%,在屬水平上,吳山貢鵝貯藏初期和中期相對豐度最高的均為假單胞菌屬和根瘤菌屬,假單胞菌屬相對豐度分別達到25%(初期)和34%(中期),根瘤菌屬相對豐度分別達到25%(初期)和20%(中期),貯藏末期的優(yōu)勢菌屬為副梭菌屬(50%)和魏斯氏菌屬(31%);同時,吳山貢鵝貯藏期間微生物的多樣性分析結果表明,貯藏末期微生物的多樣性與前期、中期有顯著性差異;對微生物基因功能進行預測,得到吳山貢鵝貯藏初期、中期和末期的菌群功能基因相似,主要涉及包括氨基酸代謝和碳水化合物代謝在內的代謝途徑等。

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