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不同植物DNA條形碼對(duì)鐵皮石斛鑒定能力的評(píng)價(jià)
來(lái)源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 183 發(fā)表時(shí)間: 2021-12-07
作者: 陳文強(qiáng),汪小福,陳笑蕓,彭城,徐俊鋒,蔡健
關(guān)鍵詞: 鐵皮石斛;DNA條形碼;分子鑒定;遺傳距離
摘要:

為選擇適合準(zhǔn)確鑒定鐵皮石斛的DNA條形碼,以25 份鐵皮石斛樣品和10 份其他不同種類(lèi)石斛為實(shí)驗(yàn)材料,利用目前常用的9 條植物DNA條形碼(ITS2、nad1、matK、ycbL、psbK-psbI、trnL-trnF、trnG-trnS、rbcL和trnH-psbA)對(duì)這些石斛材料進(jìn)行分子鑒定。結(jié)果顯示,9 條DNA條形碼的擴(kuò)增率和測(cè)序成功率均很高,通用性很強(qiáng)。其中,rbcL與trnH-psbA的種內(nèi)最大遺傳距離大于種間最小遺傳距離,不符合條形碼的基本要求,其余條形碼遺傳距離均符合種內(nèi)最大遺傳距離小于種間最小遺傳距離的要求。種間變異順序?yàn)镮TS2>trnL-trnF>trnG-trnS>psbK-psbI>ycf1b>matK>nad1,其中ITS2的進(jìn)化速率最快,變異率最高(25.1%)。ITS2和trnL-trnF對(duì)本實(shí)驗(yàn)中石斛材料的分辨率達(dá)到90.1%,建議ITS2+trnL-trnF作為鐵皮石斛種質(zhì)資源鑒定的DNA條形碼。本研究為利用DNA條形碼技術(shù)鑒別鐵皮石斛及其近源種石斛提供了參考和分子依據(jù)。

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