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REP-PCR及ERIC-PCR法對分離自海產(chǎn)品副溶血性弧菌分型分析
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 173 發(fā)表時間: 2017-06-07
作者: 馬月姣,孫曉紅,趙 勇,盧 瑛,吳啟華,潘迎捷
關(guān)鍵詞: 副溶血性弧菌;tdh;腸內(nèi)細菌基因組間重復(fù)序列分析;細菌基因外重復(fù)回文序列擴增;分型
摘要:

目的:采用細菌基因外重復(fù)回文序列擴增(REP-PCR)和腸道細菌基因間重復(fù)序列擴增(ERIC-PCR)兩種方法對副溶血性弧菌2株標準株,13株實驗室保存菌株和73株分離菌株共88株進行分子分型。方法:通過REP和ERICPCR指紋圖譜擴增,利用NTsys-pc軟件采用Dice系數(shù)對指紋圖譜進行聚類結(jié)果分析。結(jié)果:所有供試菌株可通過此兩種方法進行分型得到清晰的指紋圖譜,并反映出副溶血性弧菌具有豐富的遺傳多樣性,REP-PCR擴增出5~9條分布在609~4200bp之間的條帶,可將副溶血性弧菌分為5個群12類型,分辨指數(shù)達0.93,其中tdh+株在相似系數(shù)0.86時可聚類在第Ⅰ群;ERIC-PCR擴增出5~11條分布在400~7593bp之間的條帶,將副溶血性弧菌分為7個群11個類型,分辨指數(shù)為0.94,其中tdh+株在相似系數(shù)0.76時可聚類在第Ⅰ群。結(jié)論:兩種方法均顯現(xiàn)出很好的分型能力,能夠很好地將環(huán)境分離tdh+菌株和標準菌株聚類在一起,其中REP-PCR較ERIC-PCR重復(fù)性更好。

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