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實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR法快速定量檢測(cè)果蔬中星狀病毒
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 163 發(fā)表時(shí)間: 2017-07-24
作者: 馬?丹,魏海燕,徐蕾蕊,魏詠新,汪?琦,張西萌,付溥博,劉?莉,趙曉娟,曾?靜
關(guān)鍵詞: 星狀病毒;實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR;果蔬;定量檢測(cè)
摘要:

目的:針對(duì)不同果蔬表面建立星狀病毒富集與RNA提取方法,結(jié)合已報(bào)道的實(shí)時(shí)熒光定量逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)引物和探針,實(shí)現(xiàn)果蔬中星狀病毒的高靈敏快速定量檢測(cè)。方法:利用10 倍梯度稀釋的星狀病毒cRNA分子檢測(cè)Ct值及其對(duì)應(yīng)的初始濃度,構(gòu)建標(biāo)準(zhǔn)曲線,為星狀病毒的定量檢測(cè)提供參考。將ISO/TS 15216-2:2013針對(duì)果蔬中諾如病毒和甲肝病毒RNA的提取方法用于星狀病毒的檢測(cè),利用人工感染的大白菜和草莓樣品,分析病毒回收率、靈敏度及檢測(cè)重復(fù)性。最終通過60?份果蔬樣品的檢測(cè)驗(yàn)證該方法的實(shí)用性。結(jié)果:所建立的實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR方法擴(kuò)增效率達(dá)95.9%,檢測(cè)低限為5.6?拷貝/反應(yīng)。人工感染的大白菜樣品中病毒回收率在0.94%~9.63%之間,而人工感染草莓樣品中病毒回收率最高達(dá)1.03%。對(duì)同一感染濃度的樣品在不同時(shí)間的檢測(cè)結(jié)果變異系數(shù)均小于2%。最終檢出1?份來自北京農(nóng)貿(mào)市場(chǎng)的草莓樣品為星狀病毒陽性,檢測(cè)陽性率達(dá)1.67%。結(jié)論:建立的果蔬中星狀病毒熒光RT-PCR定量檢測(cè)方法快速、高效、靈敏,在食源性病毒的日常篩查和風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估工作中具有重要的應(yīng)用價(jià)值。

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