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微紫青霉酸性木聚糖酶xynA基因的克隆與序列分析
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 114 發(fā)表時(shí)間: 2017-07-24
作者: 侯?潔,李?琴,熊?科,徐友強(qiáng),李秀婷,
關(guān)鍵詞: 微紫青霉;酸性木聚糖酶;基因克隆;生物信息學(xué)分析
摘要:

基于酸性木聚糖酶在飼料及釀酒行業(yè)良好的應(yīng)用前景,通過基因組步移的方法克隆得到微紫青霉酸性木聚糖酶的全長(zhǎng)基因xynA,然后采取重疊延伸PCR技術(shù)進(jìn)行內(nèi)含子的切除獲得xynA的cDNA序列,并對(duì)其進(jìn)行了生物信息學(xué)分析。序列分析結(jié)果顯示xynA基因全長(zhǎng)720?bp,內(nèi)含子63?bp,cDNA全長(zhǎng)657?bp。推測(cè)該木聚糖酶編碼信號(hào)肽28?個(gè)氨基酸,成熟肽190?個(gè)氨基酸;預(yù)測(cè)該蛋白為分子質(zhì)量20.61?kD、等電點(diǎn)7.0的親水性蛋白,且分子內(nèi)不含二硫鍵。與其他真菌來源的GH11族耐酸性木聚糖酶進(jìn)行序列比對(duì),結(jié)果顯示該酶的相應(yīng)位置具有特征天冬氨酸殘基Asp,且具有糖苷水解酶11?族的保守區(qū)域特征以及典型的“右手半握”狀結(jié)構(gòu),重組木聚糖酶基因xynA能夠在大腸桿菌中成功表達(dá),比酶活力達(dá)220.5?U/mg。

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