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基于CRISPR/Cas9技術(shù)的植物乳植桿菌YZH81胞外多糖合成基因簇功能鑒定
來源:導(dǎo)入 閱讀量: 82 發(fā)表時間: 2025-03-10
作者: 黃淑婷,孫婭西,宦海琳,賈思思,趙芳,呂廣萍,楊瑤
關(guān)鍵詞: 植物乳植桿菌;胞外多糖;cps基因簇;蛋白功能
摘要:

胞外多糖(exopolysaccharides,EPS)合成基因簇是揭示乳酸菌EPS構(gòu)效關(guān)系的基礎(chǔ)。本研究前期發(fā)現(xiàn)一株高產(chǎn)EPS的植物乳植桿菌Lactiplantibacillus plantarum YZH81菌株含有可能的2 個EPS合成基因簇cps1和cps2,構(gòu)建的YZH81?cps1菌株EPS產(chǎn)量下降。本研究首先利用CRISPR/Cas9技術(shù)敲除了YZH81菌株cps2基因簇。與YZH81相比,YZH81?cps1和YZH81?cps2的EPS產(chǎn)量分別下降了22.88%和35.42%,化學組成改變也較大,突變株均未檢出鼠李糖單糖組分,而甘露糖和葡萄糖占比大幅提高。進一步利用蛋白質(zhì)組學分析了不同發(fā)酵時間(10、32 h)兩個不同cps簇的缺失相比于野生型YZH81菌株的差異蛋白29 個和22 個,京都基因與基因組百科全書和基因本體分析結(jié)果顯示差異蛋白參與YZH81菌株的生物學過程、細胞組成的代謝與加工過程,但敲除cps2簇引起的差異蛋白功能更為豐富,包括脂質(zhì)代謝、核苷酸代謝和肽聚糖的生物合成與代謝等。綜上,本研究明確了YZH81菌株具有兩個獨立的不同cps簇,并分別承擔了不同功能,為后期開展YZH81菌株的EPS益生功能構(gòu)效關(guān)系的研究提供了理論支撐。

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