領(lǐng)學(xué)術(shù)科研之先，創(chuàng)食品科技之新
—— 中國食品雜志社
通過非標(biāo)記定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)研究不同養(yǎng)殖模式大黃魚的蛋白質(zhì)差異。選取普通網(wǎng)箱養(yǎng)殖大黃魚和深水網(wǎng)箱養(yǎng)殖大黃魚，提取肌肉總蛋白，通過高效液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)進(jìn)行鑒定、分析。質(zhì)譜數(shù)據(jù)使用MaxQuant軟件將峰信號轉(zhuǎn)化為肽段/蛋白的表達(dá)矩陣數(shù)據(jù)，然后使用Perseus軟件可視化展示數(shù)據(jù)。不同養(yǎng)殖模式大黃魚蛋白質(zhì)進(jìn)行Student’s t檢驗，篩選出差異表達(dá)蛋白后并對其進(jìn)行基因功能分類、代謝通路富集和蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)分析，以P＜0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。通過數(shù)據(jù)庫比對獲得6 077 條多肽，分別對應(yīng)于1 232 個蛋白，其中130 個蛋白在大黃魚間存在顯著差異表達(dá)，76 個上調(diào)蛋白，54 個下調(diào)蛋白，其中上調(diào)倍數(shù)最高的屬于TCP伴侶蛋白，下調(diào)倍數(shù)最高的屬于α-1（I）鏈狀膠原蛋白。生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn)，不同養(yǎng)殖模式大黃魚蛋白質(zhì)的差異主要在于熱休克蛋白、伴侶蛋白、球蛋白及膠原蛋白等，而不同養(yǎng)殖模式中環(huán)境溫度可能是導(dǎo)致大黃魚蛋白質(zhì)顯著差異表達(dá)的主要因素。
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