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轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)在植物乳桿菌細(xì)菌素合成研究中的應(yīng)用研究進(jìn)展
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 216 發(fā)表時(shí)間: 2021-12-07
作者: 趙樂,孟祥晨
關(guān)鍵詞: 細(xì)菌素;植物乳桿菌;轉(zhuǎn)錄組學(xué);生物信息學(xué);合成代謝
摘要:

細(xì)菌素因具備抵御食源性致病菌和腐敗菌的特性,可作為天然無毒抗菌劑應(yīng)用在食品中。生物信息學(xué)是以計(jì)算機(jī)科學(xué)和應(yīng)用數(shù)學(xué)為基礎(chǔ)理論,將生命科學(xué)領(lǐng)域測(cè)得的生物信息經(jīng)搜索比對(duì),分析相關(guān)的核酸信息和蛋白結(jié)構(gòu)基因,從而定位功能基因的一門科學(xué)。其中,轉(zhuǎn)錄組學(xué)即從整體轉(zhuǎn)錄水平分析不同細(xì)胞或組織在特定條件下所轉(zhuǎn)錄的所有RNA,從而揭示生物學(xué)通路和調(diào)控分子機(jī)制。將轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果中獲得的海量數(shù)據(jù)與參考基因組比對(duì),即可從基因表達(dá)水平上定量分析轉(zhuǎn)錄本的遺傳信息。通過差異表達(dá)倍數(shù)篩選出差異基因,對(duì)其進(jìn)行GO(Gene Ontology)功能注釋和KEGG通路富集分析,進(jìn)而推測(cè)其功能特性,并揭示細(xì)菌素等代謝產(chǎn)物的合成機(jī)理。由于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序不存在安全隱患且屬于較為經(jīng)濟(jì)的調(diào)控方式,因此該技術(shù)有望為細(xì)菌素大規(guī)模投入生產(chǎn)提供新思路。

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