領(lǐng)學(xué)術(shù)科研之先，創(chuàng)食品科技之新
—— 中國(guó)食品雜志社
通過(guò)PacBio RS II測(cè)序平臺(tái)，對(duì)在腐敗冷鮮雞肉中分離到的1 株莓實(shí)假單胞菌（Pseudomonas fragi NMC25）進(jìn)行基因組完成圖測(cè)序，并對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行組裝、基因預(yù)測(cè)和功能注釋。同時(shí)與已公布全基因組序列的銅綠假單胞菌PAO1（P. aeruginosa PAO1）、惡臭假單胞菌KT2440（P. putida KT2440）和熒光假單胞菌F113（P. fluorescens F113）及另外2 株莓實(shí)假單胞菌分離株（P121和NRRLB-727）進(jìn)行初步比較基因組分析。結(jié)果顯示NMC25菌株基因組大小為5.152?13?Mb，GC含量為59.21%，包含1?個(gè)染色體和3?個(gè)質(zhì)粒。通過(guò)對(duì)COG、GO、KEGG和CAZy數(shù)據(jù)庫(kù)的比對(duì)分析發(fā)現(xiàn)基因組中包含大量致腐相關(guān)基因。比較基因組結(jié)果表明莓實(shí)假單胞菌NMC25與其他3 種假單胞菌的共線性序列比例較小，而同種之間與P. fragi P121的共線性比例也不足70%，說(shuō)明不同環(huán)境來(lái)源的莓實(shí)假單胞菌分離株基因組存在較大差異。本研究結(jié)果從基因水平上證明了莓實(shí)假單胞菌NMC25確實(shí)有較強(qiáng)的致腐潛力，有助于深入了解莓實(shí)假單胞菌的代謝特征，為今后闡明其對(duì)冷鮮雞肉的致腐機(jī)制提供理論支撐。
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