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不同季節(jié)新鮮鴨蛋表面污染細(xì)菌的多樣性分析
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 312 發(fā)表時(shí)間: 2021-09-30
作者: 盧昌麗,熊香元,龔慧可,任佑華,陳力力,劉焱
關(guān)鍵詞: 鴨蛋殼;季節(jié)性;高通量測(cè)序;細(xì)菌多樣性
摘要:

為研究鴨蛋殼表面污染細(xì)菌的多樣性以及季節(jié)性變化,在春、夏、秋和冬4 個(gè)季節(jié)采集新鮮鴨蛋,利用超聲波洗滌蛋殼制備細(xì)菌樣本,通過Illumina MiSeq高通量測(cè)序分析樣品細(xì)菌菌群的多樣性。結(jié)果表明,共獲得697 244 條優(yōu)化序列歸屬于650 個(gè)操作分類單元(operational taxonomic units,OTU),包括35 個(gè)門,298 個(gè)屬,447 個(gè)種。其中相對(duì)豐度占比較大的優(yōu)勢(shì)菌有:厚壁菌門(Firmicutes)芽孢桿菌屬(Bacillus)和腸球菌屬(Enterococcus),分別占比17.78%和17.16%;變形菌門(Proteobacteria)腸桿菌科(Enterobacteriaceae)埃希氏菌屬-志賀菌屬(Escherichia-Shigella)占比17.14%。4 個(gè)季節(jié)樣品的優(yōu)勢(shì)菌群相同,皆為芽孢桿菌屬(Bacillus)、腸球菌屬(Enterococcus)和埃希氏菌屬-志賀菌屬(Escherichia-Shigella),但種群結(jié)構(gòu)和物種豐度各不相同,冬季樣本Chao指數(shù)和ACE指數(shù)最大,平均分別為596.5±22.29和587.5±17.82;Shannon指數(shù)最大和Simpson指數(shù)最小,平均分別為3.52±1.02和0.1±0.07,種群復(fù)雜度表現(xiàn)最為突出;春夏秋冬四季樣品共有的OTU為35 個(gè),分別占各樣品OTU數(shù)目的0.06%~70.00%,獨(dú)有的OTU數(shù)目分別為9(春)、0(夏)、17 個(gè)(秋)和496 個(gè)(冬),各個(gè)季節(jié)樣品的菌群種類具有較大的差異性;不同季節(jié)分別有弧菌(Vibrio)、淤泥假單胞菌(Pseudomonas_caeni)、腸桿菌(Enterobacter)、溶菌桿菌(Lysinibacillus)、梭菌(Clostridium_sensu_stricto_1)等存在,部分致病菌受氣溫影響明顯。該結(jié)果為進(jìn)一步研究鴨蛋主要腐敗菌及其控制提供了理論依據(jù)。

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