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抗克倫特羅單鏈抗體基因構(gòu)建及蛋白結(jié)構(gòu)模擬
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 189 發(fā)表時(shí)間: 2017-06-07
作者: 王 弘,劉細(xì)霞,潘 科,雷紅濤,沈玉棟,孫遠(yuǎn)明*
關(guān)鍵詞: 克倫特羅|單鏈抗體|結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
摘要:

目的:構(gòu)建抗克倫特羅單鏈抗體(scFv)基因cbl,進(jìn)行蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)模擬并對(duì)其理化特性進(jìn)行分析。方法:采用重疊延伸PCR 方法,以能特異性分泌抗克倫特羅mAb 的雜交瘤細(xì)胞株5D1 為原料,構(gòu)建抗克倫特羅scFv 基因cbl,進(jìn)行測(cè)序,采用生物信息軟件對(duì)氨基酸序列推導(dǎo)并進(jìn)行結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè),同時(shí)對(duì)理化性質(zhì)進(jìn)行分析。結(jié)果:抗克倫特羅scFv 基因cbl 全長(zhǎng)720bp,對(duì)應(yīng)225 個(gè)氨基酸,單鏈抗體分子量約為25826.6,等電點(diǎn)預(yù)測(cè)值8.78,為堿性蛋白質(zhì);二級(jí)結(jié)構(gòu)顯示抗克倫特羅單鏈抗體含α螺旋20 處,β折疊99 處,β轉(zhuǎn)角28 處,隨機(jī)卷曲93 處。cbl 三級(jí)結(jié)構(gòu)建模顯示重鏈(VH)和輕鏈(VL)形成一個(gè)疏水的" 口袋",Linker 游離于此結(jié)構(gòu)之外,符合scFv 的結(jié)構(gòu)特點(diǎn),明顯具有抗原結(jié)合位點(diǎn)的空間構(gòu)象,理論上應(yīng)該具有良好的抗原結(jié)合活性。結(jié)論:構(gòu)建一個(gè)抗克倫特羅scFv 基因cbl,應(yīng)用信息學(xué)技術(shù)所獲得的預(yù)測(cè)和分析結(jié)果為抗克倫特羅單鏈抗體的進(jìn)一步表達(dá)、純化和活性研究提供信息。

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