領(lǐng)學(xué)術(shù)科研之先，創(chuàng)食品科技之新
—— 中國(guó)食品雜志社
通過(guò)PacBio Sequel II及Illumina NovaSeq 6000測(cè)序平臺(tái)對(duì)高產(chǎn)聚蘋(píng)果酸（polymalic acid，PMLA）產(chǎn)黑色素短梗霉（Aureobasidium melanogenum）基因組進(jìn)行測(cè)序，對(duì)測(cè)序得到的下機(jī)文件進(jìn)行組裝，并結(jié)合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行基因結(jié)構(gòu)注釋。結(jié)果表明，產(chǎn)黑色素短梗霉基因組中共有6 202 個(gè)基因，主要參與碳水化合物轉(zhuǎn)運(yùn)及代謝、氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)代謝、轉(zhuǎn)錄后修飾、RNA加工及修飾等生物活動(dòng)。功能注釋結(jié)果顯示基因組中有大部分基因與過(guò)氧化物體有關(guān)，進(jìn)而對(duì)菌株進(jìn)行透射電鏡拍攝，發(fā)現(xiàn)菌體中存在圓形的類過(guò)氧化物體（乙醛酸體）結(jié)構(gòu)，提示菌體可通過(guò)乙醛酸循環(huán)途徑生成蘋(píng)果酸。最后，對(duì)可能與PMLA合成有關(guān)的磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶激酶和蘋(píng)果酸合成酶進(jìn)行了蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)，發(fā)現(xiàn)這兩種蛋白可能具備合成蘋(píng)果酸的能力。本研究結(jié)果可為產(chǎn)黑色短梗霉菌株的PMLA代謝提供一定的參考，同時(shí)，組裝的基因組文件已上傳至相關(guān)數(shù)據(jù)庫(kù)，為后續(xù)的菌株開(kāi)發(fā)利用提供基礎(chǔ)。
2023年第44卷 2022年第43卷 2021年第42卷 2020年第41卷 2019年第40卷 2018年第39卷 2017年第38卷 2016年第37卷 2015年第36卷 2014年第35卷 2013年第34卷 2012年第33卷 2011年第32卷 2010年第31卷 2009年第30卷 2008年第29卷 2007年第28卷 2006年第27卷 2005年第26卷 2004年第25卷 2003年第24卷 2002年第23卷 2001年第22卷 2000年第21卷 1999年第20卷 1998年第19卷 1997年第18卷 1996年第17卷 1995年第16卷 1994年第15卷 1993年第14卷 1992年第13卷 1991年第12卷 1990年第11卷 1989年第10卷 1988年第09卷 1987年第08卷 1986年第07卷 1985年第06卷 1984年第05卷 1983年第04卷 1982年第03卷 1981年第02卷 1980年第01卷
電話: 010-87293157
地址: 北京市豐臺(tái)區(qū)洋橋70號(hào)
版權(quán)所有 @ 2023 中國(guó)食品雜志社 京公網(wǎng)安備11010602060050號(hào) 京ICP備14033398號(hào)-2
