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隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性法分析西藏牦牛奶酪中乳酸菌的遺傳多樣性
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 165 發(fā)表時間: 2017-06-07
作者: 蔣厚陽,趙國華,楊吉霞
關(guān)鍵詞: 西藏;牦牛奶酪;乳酸菌;隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性;聚類分析
摘要:

目的:利用隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性(randomly amplified polymorphic DNA,RAPD)法對西藏地區(qū)牦牛奶酪中27 株乳酸菌基因型進(jìn)行同源性分析。方法:利用5 個隨機(jī)引物對Mg2+濃度、dNTP用量、退火溫度、模版用量/引物用量(ng/pmol)4 個條件做單因素梯度試驗(yàn),建立最佳反應(yīng)條件,篩選最佳引物,然后對27 株乳酸菌和4 株乳酸菌標(biāo)準(zhǔn)菌株進(jìn)行隨機(jī)擴(kuò)增,用NTsys 2.10e軟件對擴(kuò)增條帶進(jìn)行聚類和遺傳相似性系數(shù)分析,分析結(jié)果與16S rRNA測序得到的菌種鑒定結(jié)果進(jìn)行對比。結(jié)果:31 株菌遺傳相似系數(shù)在0.72~1.00之間,當(dāng)相似性系數(shù)在0.82時,菌株被分成了8 組,菌株按照不同種屬聚類,聚類結(jié)果同16S rRNA測序結(jié)果基本一致,同時成功將Lactobacillus casei和Lactobacillus paracasei兩個亞種區(qū)分開。結(jié)論:RAPD技術(shù)可以較好地應(yīng)用于西藏地區(qū)牦牛奶酪中乳酸菌親緣性關(guān)系分析。

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