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河豚魚16S rRNA基因部分DNA序列分析及應(yīng)用
來(lái)源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 166 發(fā)表時(shí)間: 2017-06-07
作者: 陳文炳,翁國(guó)柱,陳融斌,繆婷玉,邵碧英,江樹勛,彭 娟
關(guān)鍵詞: 河豚魚;聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng);16S rRNA基因;DNA測(cè)序;物種鑒定
摘要:

應(yīng)用16S rRNA基因聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)擴(kuò)增通用引物,對(duì)3 屬13 種福建省搜集的河豚魚樣品與9 個(gè)未知物種的河豚魚樣品的16S rRNA基因序列中的部分片段進(jìn)行PCR擴(kuò)增與脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)堿基序列測(cè)定,各物種序列長(zhǎng)度在611~614 bp之間。應(yīng)用DNAMAN V6軟件進(jìn)行樣品間DNA序列同源性比對(duì)分析,建立樣品間系統(tǒng)關(guān)系同源樹。供試13 個(gè)樣品被劃分為4 個(gè)類群組,群間的同源率為87%,群內(nèi)同源率為94%~100%。根據(jù)序列同源性分析結(jié)果,9 個(gè)未知種名的樣品被歸類到3 個(gè)類群組中,推測(cè)9 個(gè)未知種名的樣品為東方鲀屬或腹刺鲀屬。探討了16S rRNA基因部分DNA序列測(cè)試及同源性分析技術(shù)在河豚魚種屬鑒別中應(yīng)用的可能性。

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