領(lǐng)學(xué)術(shù)科研之先，創(chuàng)食品科技之新
—— 中國(guó)食品雜志社
灰樹花多糖具有抗腫瘤、抗HIV、抗氧化等作用，為探明灰樹花多糖合成的遺傳基礎(chǔ)，采用Illumina高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)灰樹花轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行測(cè)序，獲得74?575?910?個(gè)reads，10.4?G數(shù)據(jù)量；將測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行de?novo拼接后得到18?077?個(gè)Unigene。對(duì)所得Unigene進(jìn)行不同數(shù)據(jù)庫比對(duì)，在Nr數(shù)據(jù)庫中有11?651?個(gè)Unigene被注釋到，其中灰樹花轉(zhuǎn)錄組與變色栓菌相似序列最多（18.74%）；有8?332?個(gè)Unigene在GO數(shù)據(jù)庫中注釋到，分為細(xì)胞組分、分子功能及生物學(xué)過程等3?大類59?個(gè)分支；與KEGG數(shù)據(jù)庫比對(duì)，共有5?200?個(gè)Unigene被注釋，分屬376?條代謝通路。從18?077?個(gè)Unigene中共找到1?155?個(gè)簡(jiǎn)單重復(fù)序列（simple sequence repeat，SSR）位點(diǎn)，其中單核苷酸重復(fù)最高，六核苷酸重復(fù)最少，A/T出現(xiàn)頻率最高。本研究中在KEGG數(shù)據(jù)庫注釋到115?個(gè)Unigene與灰樹花多糖合成有關(guān)，這些Unigene及其注釋信息為今后深入開展灰樹花多糖代謝途徑及相關(guān)功能基因等研究提供了依據(jù)。
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