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沙門(mén)菌屬特異性檢測(cè)靶點(diǎn)堿基差異位點(diǎn)的識(shí)別及其血清型決定力
來(lái)源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 158 發(fā)表時(shí)間: 2017-12-08
作者: 石秀清,周秀娟,施春雷,張芬,史賢明
關(guān)鍵詞: 沙門(mén)菌;分子血清分型;特異性檢測(cè)靶點(diǎn);食品樣品;血清鑒定
摘要:

以美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心(NCBI)已公布的28?株沙門(mén)菌(14?個(gè)血清型)全基因組序列為研究對(duì)象,對(duì)前期研究獲得的7?個(gè)沙門(mén)菌屬特異性檢測(cè)靶點(diǎn)在不同血清型間的單核苷酸多態(tài)性進(jìn)行比較分析,結(jié)果表明,S9和S69為堿基差異位點(diǎn)最多的兩個(gè)靶點(diǎn),具有沙門(mén)菌分子血清分型的潛在能力。隨后,通過(guò)分析S9和S69在沙門(mén)菌不同血清型菌株中的差異位點(diǎn),分別繪制兩個(gè)血清分型靶點(diǎn)的差異位點(diǎn)表,從而獲得了這兩個(gè)靶點(diǎn)同時(shí)用于14?個(gè)沙門(mén)菌血清型的快速分子血清分型的差異位點(diǎn)組合。在這些組合中,同一血清型具有相同的差異位點(diǎn),不同血清型可以通過(guò)差異位點(diǎn)得以區(qū)分。最后,采集食品樣品192?份,用國(guó)標(biāo)方法獲得疑似沙門(mén)菌21?株;利用血清分子分型靶點(diǎn)S9和S69進(jìn)行快速分型,并同時(shí)用傳統(tǒng)玻片凝集反應(yīng)鑒定方法進(jìn)行驗(yàn)證,兩種方法鑒定結(jié)果的符合率為100%。鑒定結(jié)果為:21?株沙門(mén)菌共包括4?個(gè)不同血清型,其中腸炎沙門(mén)菌10株、鼠傷寒沙門(mén)菌7?株、雞沙門(mén)菌2?株、紐波特沙門(mén)菌2?株。基因組序列分析結(jié)果和分離株分型結(jié)果均表明,沙門(mén)菌特異分子檢測(cè)靶點(diǎn)S9和S69相結(jié)合具備沙門(mén)菌的分子血清分型能力,以差異位點(diǎn)表為基礎(chǔ)建立的血清分型方法有望替代傳統(tǒng)的玻片凝集血清分型這一繁雜步驟,從而降低沙門(mén)菌血清鑒定的時(shí)間與成本,為聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)技術(shù)應(yīng)用于沙門(mén)菌分子血清分型提供新思路。?

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