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反油酸誘導(dǎo)人臍靜脈內(nèi)皮細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)及生物信息學(xué)分析
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 169 發(fā)表時(shí)間: 2019-09-26
作者: 邱斌,孫文佳,劉瑋,徐同成,劉麗娜,宗愛珍,賈敏,杜方嶺
關(guān)鍵詞: 反式脂肪酸|反油酸|轉(zhuǎn)錄組學(xué)|信號通路|生物信息學(xué)
摘要:

以反油酸誘導(dǎo)人臍靜脈內(nèi)皮細(xì)胞后,結(jié)合轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析及其生物信息學(xué)分析,在轉(zhuǎn)錄水平上對相關(guān)差異表達(dá)基因進(jìn)行研究。結(jié)果表明:共檢測到95?條基因顯著變化,其中31?條基因上調(diào),64?條基因下調(diào)。并通過生物信息學(xué)分析,其中參與生物進(jìn)程顯著性差異表達(dá)基因共772?條,關(guān)于細(xì)胞組成的基因顯著表達(dá)性差異基因共46?條,關(guān)于分子功能的基因顯著表達(dá)性差異基因共122?條。共檢測到93?條信號通路,其中顯著變化的有11?條,其中包括萜類骨架生物合成通路、類固醇生物合成通路和脂肪酸代謝通路等。根據(jù)蛋白質(zhì)基因互作通路圖,重點(diǎn)分析了同時(shí)參與不同通路的靶基因,包括脂肪酸合成酶、STAT4轉(zhuǎn)錄因子及IL-23細(xì)胞因子等。

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