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牛乳外泌體中miRNA的測序與分析
來源:導入 閱讀量: 197 發(fā)表時間: 2024-02-20
作者: 商靜雯, 柴玉霞, 曹雪妍, 岳喜慶, 楊梅
關鍵詞: 牛乳外泌體;Illumina測序;miRNA
摘要:

采用密度梯度離心法提取牛乳外泌體,利用Illumina測序技術對外泌體中非編碼小RNA(sRNA)進行測序,探索牛乳microRNA(miRNA)的表達譜。對原始序列進行質量控制,共獲得3 899 629 條純凈sRNA序列,長度集中于28 nt,與數(shù)據(jù)庫比對后鑒定到61 種已知miRNA,346 種新miRNA。基因本體論富集結果表明,牛乳外泌體miRNA在細胞過程、單一生物體過程、代謝過程等生物過程發(fā)揮作用;主要構成細胞、細胞器等組成;主要參與結合、催化活性、轉運蛋白活性等分子功能。京都基因與基因組百科全書通路富集結果表明,已知miRNA與新miRNA靶基因均顯著富集在百日咳(ko05133)、趨化因子信號通路(ko04062)、內吞作用(ko04144)、溶酶體(ko04142)等通路,牛乳外泌體miRNA在特定信號通路中發(fā)揮重要作用。

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