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柑橘酸腐病菌PacC的生物信息學(xué)分析及其響應(yīng)pH值的表達(dá)模式
來源:導(dǎo)入 閱讀量: 164 發(fā)表時(shí)間: 2024-02-20
作者: 鄭杰, 譚小麗, 胡近近, 陶能國, 歐陽秋麗, 李茂慧, 李路
關(guān)鍵詞: 酸腐病菌;PacC;生物信息學(xué);pH值;表達(dá)模式
摘要:

酸腐病菌(Geotrichum citri-aurantii)可調(diào)節(jié)侵染位點(diǎn)的pH值增強(qiáng)其致病性,pH值信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子PacC在真菌響應(yīng)環(huán)境pH值變化中發(fā)揮重要功能,但PacC在酸腐病菌中的作用尚不清楚。從酸腐病菌基因組中注釋到2 個PacC候選基因,對其進(jìn)行生物信息學(xué)分析,并研究不同pH值條件下的表達(dá)模式。結(jié)果表明,PacC1與PacC2屬于C2H2蛋白家族成員,且與指狀青霉(Penicillium digitatum)PacC的親緣關(guān)系較近。PacC1與PacC2在染色體位置、蛋白質(zhì)分子質(zhì)量和等電點(diǎn)等方面存在差異。離體條件下,酸腐病菌具有廣泛的pH值適應(yīng)性,最適pH值為3.0。PacC1和PacC2的表達(dá)均受pH值調(diào)控,且兩個基因的表達(dá)趨勢具有一定相似性。活體條件下,pH>3.0的宮川蜜橘果實(shí)組織中,酸腐病發(fā)病部位pH值隨著發(fā)病進(jìn)程顯著下降,而pH<3.0的尤力克檸檬果實(shí)組織中,發(fā)病部位pH值顯著上升,同時(shí)PacC1與PacC2的相對表達(dá)量均呈上升趨勢。綜上可知,環(huán)境pH值對酸腐病菌的生長有一定影響,酸腐病菌也對環(huán)境pH值有一定調(diào)節(jié)能力。由于基因結(jié)構(gòu)和理化性質(zhì)的差異,酸腐病菌的2 個PacC對pH值的響應(yīng)程度和方式有一定差別,它們對于酸腐病菌廣泛的pH值適應(yīng)性及促進(jìn)柑橘果實(shí)侵染進(jìn)程具有重要作用。

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