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基于高通量測序的浙江玫瑰醋發(fā)酵過程中細菌菌群結構及其動態(tài)演替
來源:食品科學網(wǎng) 閱讀量: 155 發(fā)表時間: 2020-03-02
作者: 方冠宇,黃炳文,蔣予箭
關鍵詞: 浙江玫瑰醋;高通量測序;細菌菌群結構;乳桿菌
摘要:

基于Illumina MiSeq高通量測序?qū)φ憬倒宕住皼_缸放水”后醋樣中的細菌DNA序列的V4區(qū)進行測序。在門水平對細菌群落進行分析,表明浙江玫瑰醋在“沖缸放水”后的發(fā)酵過程中主要菌群為變形菌門(Proteobacteria)和厚壁菌門(Firmicutes),兩者相對豐度一直處于98%以上,并且變形菌門相對豐度持續(xù)升高,厚壁菌門持續(xù)降低。在屬水平對細菌進行分析表明,浙江玫瑰醋發(fā)酵過程中主要為醋酸桿菌屬(Acetobacter)和乳桿菌屬(Lactobacillus),并且醋酸桿菌屬隨著發(fā)酵的進行相對豐度呈現(xiàn)持續(xù)上升趨勢,乳桿菌屬呈現(xiàn)下降趨勢。腸球菌屬(Enterococcus)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、芽孢桿菌屬(Bacillus)相對豐度較低,但存在于整個發(fā)酵過程。開始“沖缸放水”時的細菌組成與后期發(fā)酵有明顯差異。對浙江玫瑰醋發(fā)酵過程中乳酸菌進行了分離、鑒定,得到了4 株副干酪乳桿菌(L. paracasei),1 株清酒乳桿菌(L. sakei),1 株鼠李糖乳桿菌(L. rhamnosus),1 株干酪乳桿菌(L. casei)。將浙江玫瑰醋發(fā)酵過程中細菌組成與其他醋發(fā)酵過程細菌組成進行比較,發(fā)現(xiàn)所有醋發(fā)酵過程高豐度細菌相同,都為醋酸桿菌屬和乳桿菌屬,但低豐度細菌差異明顯。

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