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基于高通量測(cè)序分析蟹糊微生物菌群多樣性
來(lái)源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 153 發(fā)表時(shí)間: 2020-03-02
作者: 李成,孔曉雪,余炬波,鄒小欠,羅海波
關(guān)鍵詞: 蟹糊;高通量測(cè)序;菌群結(jié)構(gòu)
摘要:

為探索不同貯藏溫度下蟹糊微生物菌群結(jié)構(gòu),應(yīng)用Illumina MiSeq高通量測(cè)序技術(shù)研究蟹糊在-20 ℃和4 ℃貯藏3 d后的微生物菌群多樣性。結(jié)果表明:-20 ℃貯藏3 d的蟹糊樣品V1-V3和V3-V4區(qū)域擴(kuò)增所得微生物菌屬分別為18 屬和26 屬,4 ℃貯藏3 d的蟹糊樣品V1-V3和V3-V4區(qū)域擴(kuò)增所得微生物菌屬分別為16 屬和19 屬。相對(duì)豐度大于1%的菌屬為肉食桿菌屬(Carnobacterium)、Jeotgalibaca、環(huán)絲菌屬(Brochothrix)、葡萄球菌屬(Staphylococcus)、嗜冷桿菌屬(Psychrobacter)、弧菌屬(Vibrio)。-20 ℃貯藏3 d的蟹糊樣品優(yōu)勢(shì)菌屬為肉食桿菌屬(V1-V3,68.81%;V3-V4,69.29%)和弧菌屬(V1-V3,16.75%;V3-V4,14.39%)。4 ℃貯藏3 d的蟹糊樣品優(yōu)勢(shì)菌屬為肉食桿菌屬(V1-V3,73.37%;V3-V4,70.35%)、Jeotgalibaca(V1-V3,11.82%;V3-V4,12.35%)和葡萄球菌屬(V1-V3,5.45%;V3-V4,5.01%),同時(shí)Jeotgalibaca和葡萄球菌屬相對(duì)豐度顯著高于-20 ℃貯藏的蟹糊樣品。以上結(jié)果表明,蟹糊在不同貯藏溫度下菌群多樣性、優(yōu)勢(shì)菌屬及其相對(duì)豐度均存在顯著差異(P<0.05)。本研究為有效預(yù)防腌制生食蟹糊食源性疾病的發(fā)生及控制技術(shù)的開發(fā)提供理論依據(jù)。

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