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小分子糖及其類似物與α-葡萄糖苷酶的分子對(duì)接
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 156 發(fā)表時(shí)間: 2020-04-26
作者: 徐曉梅,溫家穎,王慶華
關(guān)鍵詞: α-葡萄糖苷酶;抑制劑;分子對(duì)接;小分子構(gòu)建
摘要:

以AutoDock 4.2分子對(duì)接軟件對(duì)20 種小分子單糖及其類似物與α-葡萄糖苷酶進(jìn)行分子模擬對(duì)接研究,分析對(duì)接結(jié)合自由能與實(shí)驗(yàn)所得IC50的關(guān)系,并根據(jù)受體與配體的相互作用進(jìn)一步優(yōu)化改造抑制劑分子結(jié)構(gòu)。結(jié)果顯示:α-葡萄糖苷酶分子中氨基酸殘基Asp542、Asp443、His600、Asp327和Arg526是化合物與酶形成氫鍵作用的重要位點(diǎn)。分別將糖環(huán)上的O原子替換為N和C原子后,前者的對(duì)接結(jié)合自由能變得更小,配體與受體結(jié)合得更好。對(duì)井岡霉胺的分子結(jié)構(gòu)改造后的對(duì)接結(jié)果顯示,六元環(huán)上的N原子和環(huán)上存在—NH2取代基在分子與α-葡萄糖苷酶對(duì)接中起非常重要的作用。本研究可為今后高效α-葡萄糖苷酶抑制劑的篩選和優(yōu)化設(shè)計(jì)提供新思路。

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