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基于高通量測序分析感染菌核病和健康桑果內(nèi)生菌群落結(jié)構(gòu)及多樣性
來源:食品科學網(wǎng) 閱讀量: 152 發(fā)表時間: 2021-12-07
作者: 彭芳芳,魏召新,李勛蘭,羅友進,韓國輝
關(guān)鍵詞: 桑果;內(nèi)生細菌;內(nèi)生真菌;群落結(jié)構(gòu);多樣性
摘要:

以感染菌核病桑果和健康桑果為材料,采用Illumina MiSeq高通量測序,分析二者內(nèi)生菌群落結(jié)構(gòu)組成及多樣性變化,充分挖掘桑果內(nèi)生菌資源,探討伴生菌與菌核病病原菌互作關(guān)系,為建立桑果微生物信息系統(tǒng)、桑果菌核病的病原學研究以及生物防治提供參考。結(jié)果表明:根據(jù)97%的序列相似性水平,可以將細菌和真菌分別歸類為281 個和259 個非重復可操作分類單元(operational taxonomic units,OTU)。內(nèi)生細菌群落以藍藻門(Cyanobacteria)、變形菌門(Proteobacteria)、厚壁菌門(Firmicutes)、擬桿菌門(Bacteroidetes)為主,Cyanobacteria_norank、Mitochondria_norank 2 個細菌屬在病果中呈明顯下降趨勢,敏感性較強。內(nèi)生真菌群落以子囊菌門(Ascomycota)、Fungi_unclassified、擔子菌門(Basidiomycota)為主,F(xiàn)ungi_unclassified、Basidiomycota受病原菌影響較大,其中Fungi_unclassified幾乎不存在于感病組,Basidiomycota下降99.07%。內(nèi)生真菌多樣性可明顯劃分感病果實和健康果實的界限,且感病果實內(nèi)生真菌多樣性遠小于健康果實。LEfSe顯著差異分析表明,泛菌屬(Pantoea)是病果中重要的細菌類群,Ascomycota及其分支錘舌菌綱(Leotiomycetes)、柔膜菌目(Helotiales)、核盤菌科(Sclerotiniaceae)和杯盤菌屬(Ciboria),糞殼菌綱(Sordariomycetes),座囊菌綱(Dothideomycetes),炭角菌目(Xylariales)及其分支(Xylariales_f_Xylariales_fam_Incertae_sedis,Monographella)是健康果實與感病果實間重要顯著差異的生物標識。

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