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PCR 方法檢測河豚魚的引物篩選及反應(yīng)體系優(yōu)化
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 146 發(fā)表時間: 2017-06-07
作者: 陳文炳,趙 晨,邵碧英,江樹勛,閆 誠,李壽崧,林河通
關(guān)鍵詞: 河豚魚|引物篩選|PCR 檢測|優(yōu)化
摘要:

根據(jù)Genbank 公布的河豚魚細胞色素b 基因序列,應(yīng)用軟件Primer Premier 5.00 版設(shè)計了7 對引物,經(jīng)過PCR 篩選,確定可以在所有8 個供試河豚魚樣品中檢出目的DNA 片段的引物HT-1,用于建立河豚魚的PCR 檢測方法。對該PCR 方法中6 個因素包括退火溫度、Mg2+ 終濃度、Taq DNA 聚合酶用量、dNTPs 終濃度、引物終濃度和模板DNA 用量進行優(yōu)化,確定優(yōu)化的PCR 擴增體系:10 × PCR 緩沖液2μL,MgCl2 終濃度1.5mmol/L,Taq DNA 聚合酶1.0U,dNTPs 終濃度300μmol/L,引物終濃度0.2μmol/L,DNA 模板400ng,加純水至總體積20μL。擴增程序定為94℃預(yù)變性5min,94℃變性30s,62℃退火30s,72℃延伸30s,40 個循環(huán),72℃延伸5min。據(jù)此建立河豚魚成分PCR 檢測方法,并通過河豚魚與非河豚魚的PCR 檢測結(jié)果比較,驗證了該方法的河豚魚特異性。研究結(jié)果還表明,該方法的檢出限為0.1%,含量為0.1% 的河豚魚樣品PCR 檢出率至少在97.5% 以上。

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