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油橄欖查爾酮合酶與查爾酮異構(gòu)酶基因全長(zhǎng)的克隆及序列分析
來(lái)源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 134 發(fā)表時(shí)間: 2017-06-07
作者: 陳文拴,黃乾明,陳華萍,楊澤身,王安逸,蘇光燦
關(guān)鍵詞: 油橄欖;查爾酮合酶;查爾酮異構(gòu)酶;基因克隆;序列分析
摘要:

查爾酮合酶(chalcone synthase,Chs)與查爾酮異構(gòu)酶(chalcone isomerase,Chi)是植物類黃酮合成代謝途徑中的兩個(gè)關(guān)鍵酶。采用同源克隆、反轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)、融合引物嵌套PCR(fusion primer and nested integrated PCR,F(xiàn)PNI-PCR)與3’-cDNA末端快速擴(kuò)增技術(shù)(rapid amplification of cDNA end,RACE)相結(jié)合,分別克隆出油橄欖chs與chi基因全長(zhǎng)。序列分析表明,油橄欖chs基因全長(zhǎng)DNA(GenBank登錄號(hào):KF935223.1)和cDNA(GenBank登錄號(hào):KF935224.1)序列分別為2 085 bp和1 173 bp,該基因的開放閱讀框(open reading frame,ORF)編碼390 個(gè)氨基酸,其氨基酸序列與葡萄和番茄全長(zhǎng)Chs氨基酸序列的相似度在90%左右。生物信息學(xué)分析表明,該基因編碼的蛋白屬于Chs蛋白家族。油橄欖chi基因全長(zhǎng)DNA(GenBank登錄號(hào):KF886190)和cDNA(GenBank登錄號(hào):KF886191)序列分別為1 373 bp和750 bp,其ORF編碼249 個(gè)氨基酸,該氨基酸序列與已報(bào)道的其他植物Chi氨基酸序列的相似度最高在65%左右,序列中包含一段由198 個(gè)氨基酸殘基組成的具有分子內(nèi)裂解酶活性的功能域,符合Chi蛋白家族特征。

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