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南極磷蝦原肌球蛋白純化鑒定、理化特性及模擬表位肽預(yù)測(cè)
來(lái)源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 159 發(fā)表時(shí)間: 2023-01-03
作者: 王珊,劉瑤,劉柯欣,張書(shū)琪,林松毅,孫娜
關(guān)鍵詞: 南極磷蝦;原肌球蛋白;提取純化;蛋白鑒定;穩(wěn)定性;生物信息學(xué);模擬表位肽
摘要:

對(duì)南極磷蝦原肌球蛋白(tropomyosin,TM)進(jìn)行提取純化與質(zhì)譜鑒定,并對(duì)其熱穩(wěn)定性、pH值穩(wěn)定性及消化穩(wěn)定性進(jìn)行研究,同時(shí)利用生物信息學(xué)對(duì)其進(jìn)行序列同源性分析、空間結(jié)構(gòu)同源建模及過(guò)敏原模擬表位肽識(shí)別。十二烷基硫酸鈉聚丙烯酰氨凝膠電泳結(jié)果顯示,經(jīng)蛋白粗提、熱除雜、等電點(diǎn)沉淀、硫酸銨鹽析等多步提純,最終僅在32?kDa附近得到一條清晰條帶。利用超高效液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用對(duì)其進(jìn)行掃描,經(jīng)UniProt數(shù)據(jù)庫(kù)檢索確定該目的蛋白為T(mén)M(Euphausia?superba),蛋白分子質(zhì)量32.6?kDa,肽段覆蓋率達(dá)97%。同源性分析結(jié)果表明南極磷蝦TM是一種高度保守蛋白,與26?種甲殼動(dòng)物的TM序列同源性在88%~98.2%之間。南極磷蝦TM對(duì)熱、酸堿及胃液消化均具有較強(qiáng)的穩(wěn)定性,而對(duì)腸液消化穩(wěn)定性較差,易被胰蛋白酶和糜蛋白酶降解生成低分子質(zhì)量肽段。通過(guò)DNAStar Protean、AntheProt、BepiPred 1.0 server、ABCpred server、Immunomedicine Group 5 種生物信息學(xué)工具最終預(yù)測(cè)識(shí)別出8 條南極磷蝦TM模擬表位肽(EAQNKETNAKADKADDEVH、DLERSEERLN、TKLAEASQAADESER、EADRKYDE、ERAEERAEAG、VSEEKANQREEAYKEQI、RSVQKLQKEVDR、VNEKEKYKGI),并在其空間結(jié)構(gòu)中進(jìn)行一一映射。本研究為南極磷蝦TM模擬表位肽的精準(zhǔn)預(yù)測(cè)識(shí)別及其相關(guān)低致敏性產(chǎn)品的開(kāi)發(fā)提供了科學(xué)依據(jù)。

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