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基于16S rDNA高通量測(cè)序方法比較新疆西北部地區(qū)乳品中微生物的多樣性
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 144 發(fā)表時(shí)間: 2017-10-10
作者: 張敏,張艷,黃麗麗,劉憶冬,周紅,倪永清
關(guān)鍵詞: 乳品;微生物多樣性;高通量測(cè)序技術(shù)
摘要:

為更加全面地了解新疆特色乳品中微生物多樣性,比較不同動(dòng)物來源的原奶和酸奶的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu),運(yùn)用高通量測(cè)序技術(shù),對(duì)乳品中細(xì)菌16S rDNA V4-V5區(qū)測(cè)序,進(jìn)而對(duì)新疆克州和塔城地區(qū)牛奶、駝奶、馬奶、羊奶、酸牛奶、酸駝奶和酸馬奶7?種乳品中細(xì)菌群落組成和多樣性進(jìn)行分析。研究共獲得539?557?條有效序列,379?個(gè)OTU。多樣性分析表明,原奶樣品中細(xì)菌Shannon-Wiener指數(shù)明顯高于酸奶樣品。微生物群落組成分析發(fā)現(xiàn),不同乳品之間菌群組成差異較大。7?種乳品中的菌群均以厚壁菌門和變形菌門為主,但原奶樣品主要以變形菌門為主,而酸奶樣品主要以厚壁菌門為主。在屬水平上,牛奶主要以假單胞菌屬(Pseudomonas)為主,駝奶主要以埃希菌屬-志賀菌屬(Escherichia-Shigella),馬奶主要以明串珠菌屬(Leuconostoc)為主,羊奶中的優(yōu)勢(shì)菌屬為乳球菌屬(Lactococcus),而酸牛奶、酸駝奶和酸馬奶都是以乳桿菌屬(Lactobacillus)為優(yōu)勢(shì)菌屬。不同動(dòng)物來源的原奶和酸奶樣品中的微生物多樣性存在顯著差異,并且原奶中檢測(cè)到的環(huán)境污染菌和致病菌(或條件致病菌)的豐度也相對(duì)較高。本研究結(jié)果將為準(zhǔn)確評(píng)估乳品中的微生物群落對(duì)新疆地區(qū)少數(shù)民族健康的影響提供一定的數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。

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