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利用Illumina MiSeq高通量測(cè)序技術(shù)分析原料乳的菌群分布
來(lái)源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 161 發(fā)表時(shí)間: 2019-09-26
作者: 于國(guó)萍,陳媛,姚宇秀,范美婧,劉鵬,董良偉
關(guān)鍵詞: Illumina MiSeq高通量測(cè)序|原料乳|菌群分布情況
摘要:

為測(cè)定原料乳中的菌群分布情況,應(yīng)用Illumina MiSeq高通量測(cè)序方法,主要對(duì)14?個(gè)奶牛場(chǎng)的原料乳進(jìn)行采集,通過(guò)DNA測(cè)序確定菌群的多樣性及致病菌的分布情況,進(jìn)行操作分類單元聚類分析、Alpha多樣性分析、物種分類分析3?方面的測(cè)定。結(jié)果表明不同牧場(chǎng)的菌群存在多樣性,位于前列的分別是腸球菌屬(Enterococcus)、芽孢桿菌屬(Bacillus)、不動(dòng)桿菌屬(Acinetobacter)、乳球菌屬(Lactococcus),同時(shí)表明,個(gè)別牛場(chǎng)原料乳中有金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)和志賀菌(Shigella)的存在。

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