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大豆過敏原11S球蛋白G2中A2鏈結(jié)合表位的預(yù)測
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 168 發(fā)表時間: 2019-09-26
作者: 劉陽星月,張迪,姚亞亞,苗字葉,劉壯,李慧靜
關(guān)鍵詞: 大豆過敏原|11S球蛋白G2中A2鏈|生物信息學(xué)軟件|蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)|三級結(jié)構(gòu)模型|B細(xì)胞表位
摘要:

采用生物信息學(xué)軟件NCBI GenBank數(shù)據(jù)庫、PDB數(shù)據(jù)庫、SWISS-MODEL、Deep View 4.1等預(yù)測11S球蛋白G2中A2鏈的二級結(jié)構(gòu)和三級結(jié)構(gòu)模型,使用DiscoTope 2.0 Server軟件預(yù)測B細(xì)胞構(gòu)象表位,發(fā)現(xiàn)構(gòu)象表位多位于無規(guī)則卷曲處。定位B細(xì)胞線性結(jié)合表位,結(jié)果表明11S球蛋白G2中A2鏈的可能線性表位有:37KPDNRIE43、79PSYTNGP85、114SQQRGRSQRP123、52WNPNNK57、196QQGGSQSQKGKQQE209、241QGENEEED248、267RKPQQEEDDDDEEEQ281、287TDKGC291。此表位預(yù)測為后續(xù)制肽、免疫等操作找出更準(zhǔn)確的肽序,以便建立適合我國大豆過敏人群的食品大豆過敏原的檢測技術(shù)。

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