領(lǐng)學(xué)術(shù)科研之先，創(chuàng)食品科技之新
—— 中國食品雜志社
規(guī)律成簇間隔短回文重復(fù)序列（clustered regularly interspaced short palindromic repeats，CRISPR）是近年在原核生物中發(fā)現(xiàn)的針對噬菌體等外源遺傳物質(zhì)的干擾而進化出的獲得性和可遺傳性生物免疫系統(tǒng)。因其序列的高度多態(tài)性及攜帶遺傳信息的可追溯性，成為分子分型方法的理想位點。本研究對江蘇地區(qū)分離的86?株空腸彎曲菌基因組進行CRISPR結(jié)構(gòu)的檢測和分析。結(jié)果表明：36%的菌株基因組含有CRISPR結(jié)構(gòu)，32?株含有確定CRISPR結(jié)構(gòu)的菌株均只含有1?個CRISPR結(jié)構(gòu)，CRISPR序列長度范圍為92～366?bp；重復(fù)序列與數(shù)據(jù)庫中出現(xiàn)頻率最高的重復(fù)序列一致；識別到的間隔序列共111?條，共分為17?種類型，有10?種類型的間隔序列與CRISPR?DB數(shù)據(jù)庫中公布的一致，有7?種間隔序列為新報道的間隔序列，共55?條，占總間隔序列的49.5%。通過同源性比對發(fā)現(xiàn)，間隔序列除與來自同屬同種的質(zhì)粒或噬菌體具有同源性外，有些還與其他致病菌的質(zhì)粒或噬菌體具有同源性，這種現(xiàn)象說明空腸彎曲菌與其他致病菌可能存在基因的水平轉(zhuǎn)移等信息交流方式。另外，通過CRISPR結(jié)構(gòu)間隔序列的多樣性，可以將38?株空腸彎曲菌野生菌株分為5?種不同的譜型。研究結(jié)果為空腸彎曲菌利用CRISPR結(jié)構(gòu)進行分型和溯源提供數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。
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