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雙孢蘑菇轉(zhuǎn)錄組測序及褐變相關(guān)基因的挖掘
來源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 179 發(fā)表時(shí)間: 2019-09-26
作者: 彭博,李炳娟,關(guān)文強(qiáng),林瓊
關(guān)鍵詞: 雙孢蘑菇|褐變|轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)|差異表達(dá)基因|多酚氧化酶
摘要:

為從分子水平研究雙孢蘑菇多酚氧化酶調(diào)控褐變的機(jī)理,以采后貯藏第1、7、14天的雙孢蘑菇菌蓋為材料,應(yīng)用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)對雙孢蘑菇菌蓋RNA進(jìn)行測序分析。共獲得168?607?212?個(gè)高質(zhì)量的clean reads;貯藏第7天和第1天相比篩選出727?個(gè)差異表達(dá)基因(differentially expressed genes,DEGs),貯藏第14天和第1天相比篩選出1?524?個(gè)DEGs;Gene Ontology(GO)功能富集和Pathway富集分析將這些差異表達(dá)基因歸類于180?個(gè)代謝途徑;從已獲得的差異表達(dá)基因中篩選得到PPO1、PPO3、PPO5、LAC1和LAC4五個(gè)多酚氧化酶相關(guān)基因。研究結(jié)果為雙孢蘑菇功能相關(guān)基因挖掘和品質(zhì)改良提供理論數(shù)據(jù)支撐。

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