領學術科研之先,創(chuàng)食品科技之新
—— 中國食品雜志社
期刊集群
基于新一代高通量測序技術分析拮抗酵母Cryptoccocus laurentii誘導處理櫻桃番茄果實后轉(zhuǎn)錄組學的變化
來源:食品科學網(wǎng) 閱讀量: 131 發(fā)表時間: 2019-09-26
作者: 唐瓊,鄭曉冬
關鍵詞: 羅倫隱球酵母;櫻桃番茄;轉(zhuǎn)錄組學;實時熒光定量聚合酶鏈式反應
摘要:

羅倫隱球酵母(Cryptococcus laurentii)作為生物激發(fā)子,能顯著誘導采后櫻桃番茄對灰葡萄孢(Botrytis cinerea)的抗性響應,但其防治機制尚未完全明確。本實驗以櫻桃番茄為材料,利用新一代高通量測序技術Illumina HiSeqTM4000對羅倫隱球酵母處理及水對照處理的番茄果肉組織進行轉(zhuǎn)錄組測序,采用生物信息學方法對差異基因進行功能注釋和通路分析,并利用實時熒光定量聚合酶鏈式反應(real time-quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)技術對隨機選取的差異表達基因進行驗證。結(jié)果表明,櫻桃番茄果實經(jīng)過羅倫隱球酵母誘導處理48?h后,共有3?141?個基因差異表達,上、下調(diào)表達基因分別為1?689?個和1?452?個,這些差異表達基因涉及多個代謝路徑,揭示羅倫隱球酵母對番茄的誘導作用是一個多代謝路徑參與的調(diào)控過程。此外,RT-qPCR驗證結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果趨勢一致。

電話: 010-87293157 地址: 北京市豐臺區(qū)洋橋70號

版權(quán)所有 @ 2023 中國食品雜志社 京公網(wǎng)安備11010602060050號 京ICP備14033398號-2

上栗县| 房山区| 郎溪县| 宁阳县| 陇南市| 卢湾区| 金秀| 霞浦县| 青铜峡市| 双柏县| 观塘区| 舞阳县| 若尔盖县| 全南县| 丰原市| 手游| 甘孜| 濮阳县| 新晃| 宁乡县| 汪清县| 东城区| 广宗县| 宜昌市| 黔西| 永清县| 泸溪县| 思茅市| 永和县| 全椒县| 新建县| 渭源县| 九龙城区| 绥滨县| 清丰县| 罗山县| 博兴县| 东方市| 桃江县| 邓州市| 和龙市|