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不同碳源培養(yǎng)下解脂耶氏酵母的轉(zhuǎn)錄組差異分析
來(lái)源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 172 發(fā)表時(shí)間: 2019-10-30
作者: 常晨,劉偉豐,郭陽(yáng),包怡紅
關(guān)鍵詞: 解脂耶氏酵母;轉(zhuǎn)錄組;差異基因
摘要:

以葡萄糖為碳源生長(zhǎng)的解脂耶氏酵母(Yarrowia lipolytica)為對(duì)照組,以油酸為碳源生長(zhǎng)的Y. lipolytica為實(shí)驗(yàn)組,利用Illumina高通量測(cè)序平臺(tái)對(duì)兩者進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,通過(guò)多種生物信息學(xué)方法對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析處理。對(duì)照組的測(cè)序結(jié)果共得到17?923?921?clean?reads;實(shí)驗(yàn)組的測(cè)序結(jié)果共得到22?656?852?clean?reads。兩個(gè)樣品差異表達(dá)基因的分析顯示共有536?個(gè)顯著性差異表達(dá)基因,376?個(gè)基因表達(dá)上調(diào),160?個(gè)基因表達(dá)下調(diào)。通過(guò)GO和KEGG富集分析可以了解這些差異基因參與的生物學(xué)調(diào)控。本研究為解脂酵母分子生物學(xué)的進(jìn)一步研究提供了參考。

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