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1 株來(lái)源于茅臺(tái)酒釀造過(guò)程宛氏擬青霉MTDF-01的全基因組測(cè)序及分析
來(lái)源:食品科學(xué)網(wǎng) 閱讀量: 183 發(fā)表時(shí)間: 2019-12-30
作者: 王和玉,劉延峰,張巧玲,堵國(guó)成,楊帆,李江華
關(guān)鍵詞: 茅臺(tái)酒;擬青霉;全基因組測(cè)序;基因注釋
摘要:

為深入了解宛氏擬青霉(Paecilomyces variotii)在醬香型白酒生產(chǎn)過(guò)程中代謝機(jī)理,為今后進(jìn)一步挖掘及調(diào)控P. variotii在白酒釀造過(guò)程中代謝提供必要生物信息學(xué)基礎(chǔ)。通過(guò)PacBio RS II測(cè)序平臺(tái)對(duì)P. variotii MTDF-01進(jìn)行全基因組測(cè)序,并且對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行基因組組裝、基因預(yù)測(cè)和功能注釋、碳水化合物基因預(yù)測(cè)、次級(jí)代謝產(chǎn)物合成基因簇預(yù)測(cè),以及與已報(bào)道全基因組序列的分離于土壤中的耐甲醛P. variotii No.5進(jìn)行比較基因組分析和共線性分析。基因組拼接得到19 個(gè)基因組骨架和19 個(gè)重疊群,總長(zhǎng)度為30 833 540 bp,GC平均含量為47.46%。基因組中預(yù)測(cè)到8 815 個(gè)基因、5 044 個(gè)簡(jiǎn)單重復(fù)序列,221 個(gè)tRNA,49 個(gè)rRNA。總共注釋基因8 662 個(gè),其中淀粉和纖維素水解酶基因分別有60 個(gè)和165 個(gè),次級(jí)代謝產(chǎn)物合成基因簇23 個(gè)。P. variotii MTDF-01與P. variotii No.5基因組存在翻轉(zhuǎn)、異位等基因組重排,兩者基因組共存在16 414 處單核苷酸堿基突變,其中有525 個(gè)堿基缺失,335 個(gè)堿基插入,15 554 個(gè)單堿基替換。本研究利用PacBio RS II測(cè)序平臺(tái)獲得了P. variotii MTDF-01的全基因組信息,并且分析P. variotii MTDF-01的潛在功能,為深入了解P. variotii在白酒生產(chǎn)過(guò)程中的代謝機(jī)理提供了遺傳信息基礎(chǔ),對(duì)今后醬香型白酒中風(fēng)味和健康物質(zhì)的調(diào)控研究具有重要意義。

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