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產(chǎn)氣莢膜梭菌實時熒光PCR和實時熒光RPA檢測方法的建立和比較
來源:食品科學網(wǎng) 閱讀量: 237 發(fā)表時間: 2020-03-02
作者: 劉立兵,李睿文,陳志敏,王金鳳,孫曉霞,袁萬哲,王建昌
關(guān)鍵詞: 產(chǎn)氣莢膜梭菌;plc基因;實時熒光聚合酶重組酶擴增;實時熒光聚合酶鏈式反應(yīng)
摘要:

根據(jù)產(chǎn)氣莢膜梭菌(Clostridium perfringens)高度保守的plc基因,設(shè)計特異性引物和探針,建立產(chǎn)氣莢膜梭菌的實時熒光聚合酶鏈式反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)和實時熒光聚合酶重組酶擴增(recombinase polymerase amplification,RPA)檢測方法。特異性分析結(jié)果表明,建立的兩種檢測方法特異性強,僅對產(chǎn)氣莢膜梭菌有特異性擴增,對其他細菌均無擴增;兩種方法的檢出限均為1.3 pg/μL。在人工污染模擬樣品的檢測中,兩種方法的檢出限均為1.0×102 CFU/mL;實時熒光RPA需要3~13 min即可實現(xiàn)對所有陽性樣品的檢測,而實時熒光PCR則需要24~46 min(Ct值為17.45~33.65)。實時熒光RPA方法在檢測時間、操作方便性和儀器便攜性方面,明顯優(yōu)于實時熒光PCR方法。本研究建立的實時熒光PCR和實時熒光RPA檢測方法特異性強、靈敏性高、操作方便,為實驗設(shè)備裝備較差的基層檢測實驗室和疫情突發(fā)現(xiàn)場產(chǎn)氣莢膜梭菌的快速檢測提供有效技術(shù)手段。

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